All Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB3

Total Repeats: 308

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_008388TTA2620721233.33 %66.67 %0 %0 %Non-Coding
2NC_008388CGT262332380 %33.33 %33.33 %33.33 %Non-Coding
3NC_008388CTT262452500 %66.67 %0 %33.33 %Non-Coding
4NC_008388TGC262792840 %33.33 %33.33 %33.33 %Non-Coding
5NC_008388TGC263333380 %33.33 %33.33 %33.33 %Non-Coding
6NC_008388TCT265195240 %66.67 %0 %33.33 %Non-Coding
7NC_008388AT3656356850 %50 %0 %0 %Non-Coding
8NC_008388GAA2658659166.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
9NC_008388CCA2659660133.33 %0 %0 %66.67 %Non-Coding
10NC_008388GTC396576650 %33.33 %33.33 %33.33 %115345695
11NC_008388GTTCCC2128028130 %33.33 %16.67 %50 %115345695
12NC_008388GTCT289809870 %50 %25 %25 %115345695
13NC_008388GCG2699610010 %0 %66.67 %33.33 %115345695
14NC_008388GCA261005101033.33 %0 %33.33 %33.33 %115345695
15NC_008388ATC261061106633.33 %33.33 %0 %33.33 %115345695
16NC_008388ATC391124113233.33 %33.33 %0 %33.33 %115345695
17NC_008388AGGC281150115725 %0 %50 %25 %115345695
18NC_008388GTT26134513500 %66.67 %33.33 %0 %115345696
19NC_008388CGG26139814030 %0 %66.67 %33.33 %115345696
20NC_008388ATC261415142033.33 %33.33 %0 %33.33 %115345696
21NC_008388GC36158615910 %0 %50 %50 %115345696
22NC_008388AGC261615162033.33 %0 %33.33 %33.33 %115345696
23NC_008388AGG261733173833.33 %0 %66.67 %0 %115345696
24NC_008388GT36187718820 %50 %50 %0 %115345696
25NC_008388GGC26194219470 %0 %66.67 %33.33 %115345696
26NC_008388GCCT28196319700 %25 %25 %50 %115345696
27NC_008388CAA261993199866.67 %0 %0 %33.33 %115345696
28NC_008388GA362047205250 %0 %50 %0 %115345696
29NC_008388CGG26205420590 %0 %66.67 %33.33 %115345696
30NC_008388CCG26209621010 %0 %33.33 %66.67 %115345696
31NC_008388TGGCCT212210621170 %33.33 %33.33 %33.33 %115345696
32NC_008388CGG26214921540 %0 %66.67 %33.33 %115345696
33NC_008388GGC26218221870 %0 %66.67 %33.33 %115345696
34NC_008388GGC26223922440 %0 %66.67 %33.33 %115345696
35NC_008388GCC26229823030 %0 %33.33 %66.67 %115345696
36NC_008388CCG26236423690 %0 %33.33 %66.67 %115345696
37NC_008388CAG262371237633.33 %0 %33.33 %33.33 %115345696
38NC_008388TG36246724720 %50 %50 %0 %115345696
39NC_008388CTT26251225170 %66.67 %0 %33.33 %115345696
40NC_008388GAA262689269466.67 %0 %33.33 %0 %115345697
41NC_008388CCA262715272033.33 %0 %0 %66.67 %115345697
42NC_008388ATG262771277633.33 %33.33 %33.33 %0 %115345697
43NC_008388CCGA282791279825 %0 %25 %50 %115345697
44NC_008388TGG26303230370 %33.33 %66.67 %0 %115345697
45NC_008388TTC26304630510 %66.67 %0 %33.33 %115345697
46NC_008388TGCG28325032570 %25 %50 %25 %Non-Coding
47NC_008388TCCG28329333000 %25 %25 %50 %Non-Coding
48NC_008388GC36330833130 %0 %50 %50 %Non-Coding
49NC_008388AACC283352335950 %0 %0 %50 %Non-Coding
50NC_008388CGG26336133660 %0 %66.67 %33.33 %Non-Coding
51NC_008388C66353835430 %0 %0 %100 %115345699
52NC_008388CAG263713371833.33 %0 %33.33 %33.33 %Non-Coding
53NC_008388GC36372137260 %0 %50 %50 %Non-Coding
54NC_008388ATT263730373533.33 %66.67 %0 %0 %Non-Coding
55NC_008388GAGGG2103748375720 %0 %80 %0 %Non-Coding
56NC_008388ACC263771377633.33 %0 %0 %66.67 %115345700
57NC_008388CGG39381938270 %0 %66.67 %33.33 %115345700
58NC_008388GAG263905391033.33 %0 %66.67 %0 %115345700
59NC_008388CGC26399540000 %0 %33.33 %66.67 %115345700
60NC_008388GCACC2104136414520 %0 %20 %60 %115345700
61NC_008388ACC264164416933.33 %0 %0 %66.67 %115345700
62NC_008388CG36422742320 %0 %50 %50 %115345700
63NC_008388GCG26437043750 %0 %66.67 %33.33 %115345700
64NC_008388CCG26439844030 %0 %33.33 %66.67 %115345700
65NC_008388GCC26444244470 %0 %33.33 %66.67 %115345700
66NC_008388GCGCG210451645250 %0 %60 %40 %115345700
67NC_008388GTT26452645310 %66.67 %33.33 %0 %115345700
68NC_008388GCC26453545400 %0 %33.33 %66.67 %115345700
69NC_008388CGC26455245570 %0 %33.33 %66.67 %115345700
70NC_008388CG36458845930 %0 %50 %50 %115345700
71NC_008388GGCAG2104618462720 %0 %60 %20 %115345700
72NC_008388GT36463246370 %50 %50 %0 %115345700
73NC_008388GGC26464846530 %0 %66.67 %33.33 %115345700
74NC_008388GAC264745475033.33 %0 %33.33 %33.33 %115345700
75NC_008388CGG26483348380 %0 %66.67 %33.33 %115345700
76NC_008388GC36489549000 %0 %50 %50 %115345700
77NC_008388GAA264924492966.67 %0 %33.33 %0 %115345700
78NC_008388AGG264992499733.33 %0 %66.67 %0 %115345700
79NC_008388GA365094509950 %0 %50 %0 %115345701
80NC_008388ACCA285107511450 %0 %0 %50 %115345701
81NC_008388GTCT28527252790 %50 %25 %25 %115345701
82NC_008388AAATC2105456546560 %20 %0 %20 %Non-Coding
83NC_008388GTC26546654710 %33.33 %33.33 %33.33 %Non-Coding
84NC_008388T66557355780 %100 %0 %0 %Non-Coding
85NC_008388AGC265584558933.33 %0 %33.33 %33.33 %Non-Coding
86NC_008388AGG265611561633.33 %0 %66.67 %0 %Non-Coding
87NC_008388TGA265621562633.33 %33.33 %33.33 %0 %115345702
88NC_008388TTATTT2125650566116.67 %83.33 %0 %0 %115345702
89NC_008388GCA265667567233.33 %0 %33.33 %33.33 %115345702
90NC_008388CAG265722572733.33 %0 %33.33 %33.33 %115345702
91NC_008388GTG26575657610 %33.33 %66.67 %0 %115345702
92NC_008388AC365790579550 %0 %0 %50 %115345702
93NC_008388TAACC2105898590740 %20 %0 %40 %115345702
94NC_008388AGTA285916592350 %25 %25 %0 %115345702
95NC_008388GAC265986599133.33 %0 %33.33 %33.33 %115345702
96NC_008388AAG266021602666.67 %0 %33.33 %0 %115345702
97NC_008388CCG26603160360 %0 %33.33 %66.67 %115345702
98NC_008388TCG26609661010 %33.33 %33.33 %33.33 %115345702
99NC_008388GAA266129613466.67 %0 %33.33 %0 %115345702
100NC_008388GA486142614950 %0 %50 %0 %115345702
101NC_008388ACG266158616333.33 %0 %33.33 %33.33 %115345702
102NC_008388ATCC286171617825 %25 %0 %50 %115345702
103NC_008388ATT266259626433.33 %66.67 %0 %0 %115345702
104NC_008388GAT266289629433.33 %33.33 %33.33 %0 %115345702
105NC_008388AGG266343634833.33 %0 %66.67 %0 %115345702
106NC_008388T66640364080 %100 %0 %0 %115345702
107NC_008388GTT26642764320 %66.67 %33.33 %0 %115345702
108NC_008388CGC26650165060 %0 %33.33 %66.67 %115345702
109NC_008388TTG26651265170 %66.67 %33.33 %0 %115345702
110NC_008388GAC266528653333.33 %0 %33.33 %33.33 %115345702
111NC_008388GAT266589659433.33 %33.33 %33.33 %0 %115345702
112NC_008388GCT26661666210 %33.33 %33.33 %33.33 %115345702
113NC_008388GAG266685669033.33 %0 %66.67 %0 %115345702
114NC_008388AAT266733673866.67 %33.33 %0 %0 %115345702
115NC_008388ACA266743674866.67 %0 %0 %33.33 %115345702
116NC_008388GAG266766677133.33 %0 %66.67 %0 %115345702
117NC_008388CTGGT210678367920 %40 %40 %20 %115345702
118NC_008388ATG266830683533.33 %33.33 %33.33 %0 %115345702
119NC_008388AG366850685550 %0 %50 %0 %115345702
120NC_008388AGA266882688766.67 %0 %33.33 %0 %115345702
121NC_008388CAA266892689766.67 %0 %0 %33.33 %115345702
122NC_008388GGC26691769220 %0 %66.67 %33.33 %115345702
123NC_008388TGC26692369280 %33.33 %33.33 %33.33 %115345702
124NC_008388TTG26694469490 %66.67 %33.33 %0 %115345702
125NC_008388GCT26695369580 %33.33 %33.33 %33.33 %115345702
126NC_008388GT36705270570 %50 %50 %0 %115345702
127NC_008388CTT26715971640 %66.67 %0 %33.33 %115345702
128NC_008388CG36717471790 %0 %50 %50 %115345702
129NC_008388TGAA287193720050 %25 %25 %0 %115345702
130NC_008388GCTT28730273090 %50 %25 %25 %115345702
131NC_008388TTTC28744974560 %75 %0 %25 %115345702
132NC_008388TCAG287468747525 %25 %25 %25 %115345702
133NC_008388CGG26753275370 %0 %66.67 %33.33 %115345702
134NC_008388TGA267542754733.33 %33.33 %33.33 %0 %115345702
135NC_008388GTC26769376980 %33.33 %33.33 %33.33 %115345702
136NC_008388ATC267712771733.33 %33.33 %0 %33.33 %115345702
137NC_008388AGA267731773666.67 %0 %33.33 %0 %115345702
138NC_008388GGCT28773777440 %25 %50 %25 %115345702
139NC_008388CCTAC2107767777620 %20 %0 %60 %115345702
140NC_008388TGT26788278870 %66.67 %33.33 %0 %115345703
141NC_008388CGAG287906791325 %0 %50 %25 %115345703
142NC_008388GACT288056806325 %25 %25 %25 %115345703
143NC_008388GAG268328833333.33 %0 %66.67 %0 %115345703
144NC_008388ATT268409841433.33 %66.67 %0 %0 %115345703
145NC_008388TTC26867586800 %66.67 %0 %33.33 %115345703
146NC_008388GAT268681868633.33 %33.33 %33.33 %0 %115345703
147NC_008388AGA268710871566.67 %0 %33.33 %0 %115345703
148NC_008388GGC26878587900 %0 %66.67 %33.33 %Non-Coding
149NC_008388ACT268851885633.33 %33.33 %0 %33.33 %Non-Coding
150NC_008388AAC268906891166.67 %0 %0 %33.33 %Non-Coding
151NC_008388CGC26893789420 %0 %33.33 %66.67 %Non-Coding
152NC_008388CA369027903250 %0 %0 %50 %Non-Coding
153NC_008388TCAT289044905125 %50 %0 %25 %Non-Coding
154NC_008388TAC269120912533.33 %33.33 %0 %33.33 %Non-Coding
155NC_008388GCT26913791420 %33.33 %33.33 %33.33 %Non-Coding
156NC_008388GC36917991840 %0 %50 %50 %Non-Coding
157NC_008388CTTG28919392000 %50 %25 %25 %Non-Coding
158NC_008388CGAG289220922725 %0 %50 %25 %Non-Coding
159NC_008388TCT26923092350 %66.67 %0 %33.33 %Non-Coding
160NC_008388GGA269267927233.33 %0 %66.67 %0 %Non-Coding
161NC_008388TCC26927592800 %33.33 %0 %66.67 %Non-Coding
162NC_008388CTC26932293270 %33.33 %0 %66.67 %Non-Coding
163NC_008388GAA269330933566.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
164NC_008388AT369434943950 %50 %0 %0 %Non-Coding
165NC_008388GCT26944094450 %33.33 %33.33 %33.33 %Non-Coding
166NC_008388CT36944494490 %50 %0 %50 %Non-Coding
167NC_008388CTT26951695210 %66.67 %0 %33.33 %Non-Coding
168NC_008388CAA269540954566.67 %0 %0 %33.33 %Non-Coding
169NC_008388TGCCC210967096790 %20 %20 %60 %Non-Coding
170NC_008388ATC269765977033.33 %33.33 %0 %33.33 %115345704
171NC_008388GAC269792979733.33 %0 %33.33 %33.33 %115345704
172NC_008388GC36987898830 %0 %50 %50 %115345704
173NC_008388AGC269910991533.33 %0 %33.33 %33.33 %115345704
174NC_008388CGACA210100431005240 %0 %20 %40 %115345704
175NC_008388GCC2610063100680 %0 %33.33 %66.67 %115345704
176NC_008388CAG26101921019733.33 %0 %33.33 %33.33 %115345704
177NC_008388AGA26102011020666.67 %0 %33.33 %0 %115345704
178NC_008388AGC26102341023933.33 %0 %33.33 %33.33 %115345704
179NC_008388GC3610238102430 %0 %50 %50 %115345704
180NC_008388GTT2610262102670 %66.67 %33.33 %0 %115345704
181NC_008388AGCG28102751028225 %0 %50 %25 %115345704
182NC_008388GCG2610289102940 %0 %66.67 %33.33 %115345704
183NC_008388CG3610293102980 %0 %50 %50 %115345704
184NC_008388AGT26103121031733.33 %33.33 %33.33 %0 %Non-Coding
185NC_008388GCG2610362103670 %0 %66.67 %33.33 %Non-Coding
186NC_008388CCG2610371103760 %0 %33.33 %66.67 %Non-Coding
187NC_008388AGA26103931039866.67 %0 %33.33 %0 %115345705
188NC_008388ACA26104541045966.67 %0 %0 %33.33 %115345705
189NC_008388AAT26104601046566.67 %33.33 %0 %0 %115345705
190NC_008388GAC26104661047133.33 %0 %33.33 %33.33 %115345705
191NC_008388CA36104821048750 %0 %0 %50 %115345705
192NC_008388TAT26105201052533.33 %66.67 %0 %0 %115345705
193NC_008388TGG2610558105630 %33.33 %66.67 %0 %115345705
194NC_008388GTG2610582105870 %33.33 %66.67 %0 %115345705
195NC_008388TCA26105951060033.33 %33.33 %0 %33.33 %115345705
196NC_008388ACG26106201062533.33 %0 %33.33 %33.33 %115345705
197NC_008388GAA26106301063566.67 %0 %33.33 %0 %115345705
198NC_008388GCC2610679106840 %0 %33.33 %66.67 %115345705
199NC_008388GTC2610689106940 %33.33 %33.33 %33.33 %115345705
200NC_008388CGT2610697107020 %33.33 %33.33 %33.33 %115345705
201NC_008388CAA26107061071166.67 %0 %0 %33.33 %115345705
202NC_008388AAG26107321073766.67 %0 %33.33 %0 %115345705
203NC_008388AGT26107671077233.33 %33.33 %33.33 %0 %115345705
204NC_008388ATT26107741077933.33 %66.67 %0 %0 %115345705
205NC_008388ATT26107941079933.33 %66.67 %0 %0 %115345705
206NC_008388GCC2610963109680 %0 %33.33 %66.67 %115345705
207NC_008388GTC2610977109820 %33.33 %33.33 %33.33 %115345705
208NC_008388AGGTC210110091101820 %20 %40 %20 %115345705
209NC_008388AGA26110551106066.67 %0 %33.33 %0 %115345705
210NC_008388ATG26112351124033.33 %33.33 %33.33 %0 %115345705
211NC_008388GCT2611286112910 %33.33 %33.33 %33.33 %115345705
212NC_008388TGA26113061131133.33 %33.33 %33.33 %0 %115345705
213NC_008388GCA26113381134333.33 %0 %33.33 %33.33 %115345705
214NC_008388TGC2611381113860 %33.33 %33.33 %33.33 %115345705
215NC_008388CAA39113891139766.67 %0 %0 %33.33 %115345705
216NC_008388TGA26117491175433.33 %33.33 %33.33 %0 %115345706
217NC_008388TAA26118031180866.67 %33.33 %0 %0 %115345706
218NC_008388TCA26118481185333.33 %33.33 %0 %33.33 %115345706
219NC_008388CAGA28118631187050 %0 %25 %25 %115345706
220NC_008388GGAT28119471195425 %25 %50 %0 %115345706
221NC_008388CCGA28119601196725 %0 %25 %50 %115345706
222NC_008388ACTC28119681197525 %25 %0 %50 %115345706
223NC_008388GGA26120651207033.33 %0 %66.67 %0 %115345706
224NC_008388TGT2612312123170 %66.67 %33.33 %0 %115345706
225NC_008388TTG2612443124480 %66.67 %33.33 %0 %115345706
226NC_008388CTTG2812458124650 %50 %25 %25 %115345706
227NC_008388AGA26124751248066.67 %0 %33.33 %0 %115345706
228NC_008388ATT26124971250233.33 %66.67 %0 %0 %115345706
229NC_008388CGA26125111251633.33 %0 %33.33 %33.33 %115345706
230NC_008388GA36125351254050 %0 %50 %0 %115345706
231NC_008388GAT26126771268233.33 %33.33 %33.33 %0 %115345706
232NC_008388CT3612800128050 %50 %0 %50 %115345707
233NC_008388TGT2612833128380 %66.67 %33.33 %0 %115345707
234NC_008388TGCAT210129181292720 %40 %20 %20 %115345707
235NC_008388CGT2612940129450 %33.33 %33.33 %33.33 %115345707
236NC_008388AGAT28130051301250 %25 %25 %0 %115345707
237NC_008388GGC2613017130220 %0 %66.67 %33.33 %115345707
238NC_008388TCT2613056130610 %66.67 %0 %33.33 %115345707
239NC_008388TGC2613088130930 %33.33 %33.33 %33.33 %115345707
240NC_008388GAC26131151312033.33 %0 %33.33 %33.33 %115345707
241NC_008388TTC2613139131440 %66.67 %0 %33.33 %115345707
242NC_008388AAT26131481315366.67 %33.33 %0 %0 %115345707
243NC_008388CCAGA210131791318840 %0 %20 %40 %115345707
244NC_008388GGT2613254132590 %33.33 %66.67 %0 %115345707
245NC_008388GTT2613277132820 %66.67 %33.33 %0 %115345707
246NC_008388AGT26133421334733.33 %33.33 %33.33 %0 %115345707
247NC_008388ACC26133611336633.33 %0 %0 %66.67 %115345707
248NC_008388TGAA28133831339050 %25 %25 %0 %115345707
249NC_008388TCT2613432134370 %66.67 %0 %33.33 %115345707
250NC_008388TCG2613620136250 %33.33 %33.33 %33.33 %115345707
251NC_008388TGG2613657136620 %33.33 %66.67 %0 %115345708
252NC_008388GC51013670136790 %0 %50 %50 %115345708
253NC_008388ACC26136851369033.33 %0 %0 %66.67 %115345708
254NC_008388ACGC28138491385625 %0 %25 %50 %115345708
255NC_008388CCA26138601386533.33 %0 %0 %66.67 %115345708
256NC_008388GAC26138831388833.33 %0 %33.33 %33.33 %115345708
257NC_008388TCA26139221392733.33 %33.33 %0 %33.33 %115345708
258NC_008388CG3613939139440 %0 %50 %50 %115345708
259NC_008388GTG2613960139650 %33.33 %66.67 %0 %115345708
260NC_008388GCGT2813971139780 %25 %50 %25 %115345708
261NC_008388ACC26139871399233.33 %0 %0 %66.67 %115345708
262NC_008388CAG26140071401233.33 %0 %33.33 %33.33 %115345708
263NC_008388TCA26140491405433.33 %33.33 %0 %33.33 %115345708
264NC_008388ACA26140581406366.67 %0 %0 %33.33 %115345708
265NC_008388CCA26141641416933.33 %0 %0 %66.67 %115345708
266NC_008388TTC2614213142180 %66.67 %0 %33.33 %115345708
267NC_008388TTC2614276142810 %66.67 %0 %33.33 %115345708
268NC_008388CAA26144271443266.67 %0 %0 %33.33 %115345708
269NC_008388TTC2614479144840 %66.67 %0 %33.33 %115345708
270NC_008388CGC2614523145280 %0 %33.33 %66.67 %115345708
271NC_008388CAC26145411454633.33 %0 %0 %66.67 %115345708
272NC_008388GGAA28145711457850 %0 %50 %0 %115345708
273NC_008388ATC26146081461333.33 %33.33 %0 %33.33 %115345708
274NC_008388GTC2614632146370 %33.33 %33.33 %33.33 %115345708
275NC_008388ATC26146421464733.33 %33.33 %0 %33.33 %115345708
276NC_008388TTC2614663146680 %66.67 %0 %33.33 %115345708
277NC_008388CTT2614683146880 %66.67 %0 %33.33 %115345708
278NC_008388A661476114766100 %0 %0 %0 %115345708
279NC_008388TTTC2814850148570 %75 %0 %25 %Non-Coding
280NC_008388TA36149061491150 %50 %0 %0 %115345709
281NC_008388CAG26149641496933.33 %0 %33.33 %33.33 %115345709
282NC_008388CTT2615105151100 %66.67 %0 %33.33 %115345709
283NC_008388GTC2615116151210 %33.33 %33.33 %33.33 %115345709
284NC_008388TCAT28152401524725 %50 %0 %25 %115345710
285NC_008388CCA26153011530633.33 %0 %0 %66.67 %115345710
286NC_008388CAG26153791538433.33 %0 %33.33 %33.33 %115345710
287NC_008388CAC26154011540633.33 %0 %0 %66.67 %115345710
288NC_008388CTT2615433154380 %66.67 %0 %33.33 %115345710
289NC_008388CG3615533155380 %0 %50 %50 %115345710
290NC_008388TGG2615610156150 %33.33 %66.67 %0 %115345710
291NC_008388CATGC210156651567420 %20 %20 %40 %115345710
292NC_008388TGT2615839158440 %66.67 %33.33 %0 %Non-Coding
293NC_008388ATTT28159051591225 %75 %0 %0 %Non-Coding
294NC_008388GGC2615999160040 %0 %66.67 %33.33 %Non-Coding
295NC_008388CA36160071601250 %0 %0 %50 %Non-Coding
296NC_008388CATCC210160451605420 %20 %0 %60 %Non-Coding
297NC_008388CTT2616072160770 %66.67 %0 %33.33 %Non-Coding
298NC_008388AGG26160971610233.33 %0 %66.67 %0 %Non-Coding
299NC_008388TGC2616105161100 %33.33 %33.33 %33.33 %Non-Coding
300NC_008388ACC26161551616033.33 %0 %0 %66.67 %Non-Coding
301NC_008388ATC26162271623233.33 %33.33 %0 %33.33 %Non-Coding
302NC_008388GAA26162731627866.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
303NC_008388CCG2616343163480 %0 %33.33 %66.67 %Non-Coding
304NC_008388AGT26163721637733.33 %33.33 %33.33 %0 %Non-Coding
305NC_008388CTT2616396164010 %66.67 %0 %33.33 %Non-Coding
306NC_008388CAC26164461645133.33 %0 %0 %66.67 %Non-Coding
307NC_008388GCG2616478164830 %0 %66.67 %33.33 %Non-Coding
308NC_008388TTC2616523165280 %66.67 %0 %33.33 %Non-Coding